يتم احتساب قيمة Q-value لـ 49 ٪ فقط من القيم p باستخدام أي معرفة بالإيجابيات الحقيقية أو الخاطئة الفعلية. إنه يشير إلى أن 49 ٪ من خطوط الخلايا المقبولة هي إيجابيات كاذبة. وهكذا توفر القيم Q تقديرًا ممتازًا لـ FDR.
كيف تحسب معدل الاكتشاف الخاطئ؟
معدل الاكتشاف الخاطئ هو نسبة عدد النتائج الإيجابية الخاطئة إلى عدد نتائج الاختبار الإيجابية الكلية . من بين 10،000 شخص تم إعطاء الاختبار ، هناك 450 نتائج إيجابية حقيقية (مربع في أعلى اليمين) و 190 نتائج إيجابية خاطئة (مربع في أسفل اليمين) ليصبح المجموع 640 نتائج إيجابية.
ما هو معدل الاكتشاف الخاطئ في RNA seq؟
قيمة FDR هي قيمة p تم ضبطها لاختبارات متعددة (بواسطة إجراء Benjamini-Hochberg). إنه يمثل “معدل الاكتشاف” ، وهو يصحح للاختبار المتعدد من خلال إعطاء نسبة الاختبارات فوق عتبة ألفا التي ستكون إيجابيات خاطئة (أي ، تم اكتشافها عندما تكون الفرضية الفارغة صحيحة). < /p>
ما هي القيمة p و fdr؟
FDR هو المعدل الذي يسمى HAME هي حقًا NULL . إن FDR بنسبة 5 ٪ يعني ، من بين جميع الميزات التي تسمى 5 ٪ ، 5 ٪ من هذه الفرق حقًا. مثلما قمنا بتعيين ألفا كعدوى لقيمة p للسيطرة على FPR ، يمكننا أيضًا تعيين عتبة لقيمة Q ، وهو التناظرية FDR للقيمة p.
ما هي القيمة p في RNA seq؟
القيمة p هي مقياس لمدى احتمال الحصول على هذه البيانات الموضعية إذا لم يكن هناك اختلاف حقيقي . لذلك ، تشير قيمة p الصغيرة إلى أن هناك فرصة ضئيلة للحصول على هذه البيانات في حالة عدم وجود فرق حقيقي ، وبالتالي تقرر أن الفرق في بيانات التعبير الجماعي مهم.
ما هو خطأ الأسرة الحكيمة؟
معدل الخطأ العائلي (FWE أو FWER) هو احتمال التوصل إلى نتيجة خاطئة واحدة على الأقل في سلسلة من اختبارات الفرضية . بمعنى آخر ، إنه احتمال ارتكاب خطأ واحد على الأقل. … يسمى FWER أيضًا تضخم ألفا أو خطأ تراكمي I خطأ.
كيف يتم حساب قيمة Q؟
وبالتالي فإن معادلة القيمة Q-value هي حرفيًا الإيجابيات الخاطئة المتوقعة القائمة على القيمة p ، مقسومة على العدد الإجمالي للإيجابيات المقبولة فعليًا في نفس القيمة p . يمكنك استخدام القيمة Q-value مثل قيمة p. على سبيل المثال ، قد تختار قبول جميع النتائج بقيمة Q 0.25 أو أقل.
هل معدل الاكتشاف الخاطئ هو نفسه معدل إيجابي خاطئ؟
على سبيل المثال ، يعني معدل إيجابي كاذب 5 ٪ أنه في المتوسط 5 ٪ من الميزات الفارغة حقًا في الدراسة سيسمى مهم . يعني FDR (معدل الاكتشاف الخاطئ) بنسبة 5 ٪ أنه من بين جميع الميزات التي تسمى مهمة ، فإن 5 ٪ من هذه الفرق هي حقًا في المتوسط.
هل قيمة p معدل إيجابي خاطئ؟
الإيجابية هي نتيجة مهمة ، أي أن القيمة p أقل من القيمة المقطوعة ، عادة 0.05. إيجابي كاذب هو عندما تحصل على فرق كبير حيث ، في الواقع ، لا يوجد شيء . كما ذكرت أعلاه ، فإن القيمة p هي فرصة أن تحدث هذه البيانات نظرًا لعدم وجود فرق بالفعل.
هل FDR أفضل من قيمة p؟
SO ، يوفر FDR ثقة أكبر من مجرد قيمة p . عادة ، تعتبر النتائج أقل من 0.05 حقيقية. ومع ذلك ، فإن هذه الإحصائيات تخبرك فقط إذا كانت الاختلافات التي لوحظت بسبب فرصة أم لا ، أي إذا كانت حقيقية ويمكن الوثوق بها.
ما هي قيمة FDR جيدة؟
عصا مع <0.05 لـ FDR. الشيء الجيد في معدل الاكتشاف الخاطئ (FDR) هو أنه يحتوي على معنى واضح وسهل الفهم. إذا خفضت بقيمة FDR 0.1 (10 ٪) ، فإن قائمة الزيارات المهمة الخاصة بك لها (في التوقع) أكثر من 10 ٪ إيجابيات كاذبة.
ماذا تمثل FDR؟
FDR أو Franklin D. Roosevelt (1882 € “1945) كان الرئيس 32 للولايات المتحدة ، ويخدم من 1933 إلى 1945.
لماذا يمثل الاختبار المتعدد مشكلة؟
ما هي مشكلة الاختبار المتعددة؟ إذا قمت بإجراء اختبار فرضية ، فهناك فرصة صغيرة (عادة حوالي 5 ٪) ستحصل على نتيجة وهمية وهمية. إذا قمت بتشغيل آلاف الاختبارات ، فإن يزيد عدد الإنذارات الخاطئة بشكل كبير .
ما هو Stepup الخاص بـ FDR؟
الملخص. يتحكم Benjaminiâ € ‘Hochberg في إجراء الاكتشاف الخاطئ (FDR) بشرط أن يكون لإحصائيات الاختبار تبعية معينة للانحدار.
ما هي قيمة Q في الفيزياء؟
في الفيزياء النووية والكيمياء ، تكون قيمة Q لتفاعل كمية الطاقة التي تم امتصاصها أو إطلاقها أثناء التفاعل النووي . تتعلق القيمة بمحتوى enthalpy من التفاعل الكيميائي أو طاقة منتجات الانحلال المشعة.
ما هو اختبار فرضية Q؟
في اختبار الفرضية الإحصائية ، وخاصة اختبار الفرضيات المتعددة ، توفر القيمة Q وسيلة للتحكم في معدل الاكتشاف الخاطئ الإيجابي (PFDR) . …
ماذا يقف P و Q في الإحصائيات؟
يشير
p إلى نسبة عناصر العينة التي لها سمة معينة . تشير Q إلى نسبة عناصر العينة التي لا تحتوي على سمة معينة ، لذلك Q = 1 – p. … n هو عدد العناصر في عينة.
كيف يمكنك تقليل خطأ من النوع 1 في الإحصائيات؟
يمكن تقليل احتمال خطأ من النوع 1 (رفض فرضية فارغة حقيقية) عن طريق اختيار مستوى أصغر من الأهمية î ± قبل إجراء اختبار (يتطلب قيمة p أصغر لرفض H0 ).
ما هو التضخم خطأ من النوع 1؟
يحدث معدل الخطأ من النوع الأول عندما يحاول الشخص اختبار متغير آخر يرتبط بالنسخة الحقيقية للمتغير الخاضع للرقابة ، في حين أن “controlling” للنسخة الخاضعة للرقابة مع العادية الانحدار.
لماذا FDR أفضل من fwer؟
يحد
التحكم في FWER من احتمال اكتشاف واحد كاذب على الأقل ، في حين أن حدود التحكم في FDR (بالمعنى الفضفاض) هي النسبة المتوقعة من الاكتشافات الخاطئة. وبالتالي ، فإن إجراءات FDR لديها قدرة أكبر على تكلفة زيادة معدلات أخطاء النوع الأول ، أي رفض الفرضيات الفارغة الموجودة بالفعل.
ما هي القيمة p جيدة المعدل؟
يمكنك ضبط مستوى الأهمية على أي احتمال تريده. … إذا كانت المقارنة المعينة ذات دلالة إحصائية من خلال الحسابات الأولى (مستوى أهمية 5 ٪) ولكن ليس للثاني (مستوى أهمية 1 ٪) ، يجب أن تكون قيمة P المعدلة بين 0.01 و 0.05 ، قل 0.0323.
ما هي القيمة p في التعبير الجيني؟
القيمة p هي احتمال النتيجة التجريبية كما لوحظ أو أكثر تطرفًا ، إذا لم يكن هناك فرق في التعبير بين الظروف التجريبية. … يمكن أن تكون القيمة p بمثابة مقياس احتمال لتحديد الجينات المعبر عنها تفاضليًا من مستوى أهمية محدد مسبقًا (عتبة القطع).
ماذا يعني FDR 0.1؟
يمكنك استخدام FDR أو 0.1 إذا كان عدد Diff. الجينات المعبر عنها (DEGs) من DESEQ2 ليست كبيرة (> 100 أو أكثر). عادةً ما تعني FDR من 0.1 أن هناك فرصة لأن 10 ٪ من الجينات ليست إيجابية كاذبة ، أي إذا كانت 100 جين تسمى degs ، فإن حوالي 10 جينات موجبة.